Эндокри́нная дисфу́нкция — нарушение функции эндокринных желез и органов, выполняющих эндокринные функции: гипофиза, поджелудочной железы, надпочечников, паращитовидной и щитовидной желез.

По классификации эндокринопатий эндокринная дисфункция наряду с гиперфункцией и гипофункцией относится к нарушениям инкреторной активности железы. Дисфункциональная эндокринопатия есть качественное изменение инкреции (гиперфункциональная — чрезмерно высокая инкреция, гипофункциональная — чрезмерно низкая) и представляет собой «разнонаправленные изменения продукции гормонов в одном и том же эндокринном органе или образование их атипичных форм».

Гиперфункция, гипофункция или дисфункция желез внутренней секреции являются основой для эндокринных заболеваний.Кроме того эндокринная дисфункция может стать причиной для психиатрических расстройств.